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Falls du nur einen Server zur Verfügung hast könntest du das ganze durch 2 virtuelle Server lösen.
Das geht sowohl unt er Windows als auch unter Linux mit VMWare und ist sogar kostenlos.
Den Tip mit IPCop finde ich sehr gut. Du solltest weder den Clients noch dem Server(dem Server am besten garnicht) direkten Zugriff auf das Internet gestatten. Auch solltest du dir über einen "online" Virensacnner gedanken machen. Hier würde der Server den Traffic analysieren und die Viren erst garnicht zu den Clients durchlassen.

Wenn du noch Fragen hast kannst du dich gerne melden.
Gruß Björn