Ich halte es für unwahrscheinlich, daß die Lichtmaschine wegen der Gelbatterie durchbrennt.
Aber das kann man vermutlich nur durch Messen rausfinden:
* Strom in allen 3 Lichtmaschinenphasen einzeln messen (geht recht komfortabel mit einem Zangenamperemeter), die müssen Synchron sein.
* Strom messen der aus dem Regler raus fließt
* Strom messen der in die Batterie reinfließt
Solange die Batterie nicht nennenswert entladen ist, sollte sich der Ladestrom im sehr niedrigen einstelligen Amperebereich bewegen.
Edit: Sowas ähnliches wie das hier
https://www.amazon.de/dp/B01MRG8ZG7 benutze ich dafür, das ist ausreichend genau und günstig.
Das mit den 2- und 3-Phasigen Reglern war übrigens bei den Suzuki GS die viele Generationen vor der 2-Zylinder GS500E gebaut wurden (in den 1970ern) mal so, denn da wurde die dritte Phase mit dem Lichtschalter erst zugeschaltet. Die GS500E ab 1989 braucht immer einen 3-Phasigen Regler.
GS-Classic ist eher eine Plattform für die etwas älteren Suzukis. Die GS500E ab 1989 ist dafür schon etwas zu modern
Der Regler ist zwar primitiv, aber halt doch so komplex, daß er trotz richtiger Meßwerte (dabei werden ja nur die Diodenstrecken statisch vermessen) laut Werkstatthandbuch trotzdem kaputt sein klann.
Wenn der dann z.B. eine Phase dauerhaft kurzschließt oder so, dann ist es natürlich möglich, daß diese dann Schaden nimmt.