Bei deinem Baujahr ist das der richtige Filter.
Erst ab 1996 (bis 2003) gab es unterschiedliche Filter offen/gedrosselt.
Würde aber nicht für die stetige Verschlechterung sorgen.
Vielleicht hast du ein wirklich "krummes" Setup erwischt...Leerlaufdrehzahl vs. Leerlaufgemischregulierschrauben.
Lass die Kiste mal im Stand ne ganze Weile warmlaufen, stell die Leerlaufdrehzahl auf 1500 und versuch dann das Leerlaufgemisch einzustellen:
http://forum.gs-500.de/showthread.php?t=33313
Beim ersten Video:
Meinst du mit Klappern das "Husten" verbunden mit Drehzahlabfall?
Das kommt von schlechtem Leerlaufgemisch...wenn du Falschluft ausgeschlossen hast (bei laufendem Motor Vergaserdeckel und Ansaugstutzen (besonders Übergang Motor-Ansaugstutzen) mit Bremsenreiniger besprühen - ändert sich die Drehzahl zieht es dort Falschluft), das Leerlaufgemisch und -Drehzahl eingestellt hast, kannst du die Vergaser synchronisieren (lassen). Dann sollte das verschwinden.
Zuvor lohnt sich eine Ventilspielkontrolle (ist eh alle 6000 km vorgesehen). Wenn man da etwas verstellen muss, muss man danach neu synchronisieren.
Synchronisierung sorgt aber nur für runden Leerlauf.
Im Video #2 klingt es so, als würde die Kiste nur auf einem Zylinder laufen.
Kann am Vergaser liegen (tut es meisten), aber auch an der Zündung.
Finde heraus, welcher Zylinder nicht mitläuft (Zündkerzenstecker abziehen), und checke dann mal, ob die Seite die nicht mitläuft überhaupt funkt.
Wenn es nicht ganz klar ist, mal Zündkerzen rechts/links tauschen und wenn das unauffällig ist auch mal Spulen samt Stecker rechts/links tauschen.